Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPS1P31327 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPS1P31327 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms