Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms