Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD247P20963 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD247P20963 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD247P20963 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD247P20963 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms