Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPN3P20807 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPN3P20807 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPN3P20807 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms