Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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