Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CTLA4P16410 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CTLA4P16410 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CTLA4P16410 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CTLA4P16410 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CTLA4P16410 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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