Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms