Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms