Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BCKDHAP12694 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BCKDHAP12694 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BCKDHAP12694 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BCKDHAP12694 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BCKDHAP12694 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BCKDHAP12694 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHAP12694 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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