Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms