Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPLO60437 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPLO60437 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPLO60437 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPLO60437 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPLO60437 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms