Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EDIL3O43854 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDIL3O43854 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms