Protein–RNA interactions for Protein: O43699

SIGLEC6, Sialic acid-binding Ig-like lectin 6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGLEC6O43699 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SIGLEC6O43699 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms