Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MTSS1O43312 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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