Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBDO15205 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBDO15205 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms