Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CEP290O15078 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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