Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms