Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms