Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PCH4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PCH4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PCH4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PCH4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms