Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms