Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SOBPA7XYQ1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SOBPA7XYQ1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SOBPA7XYQ1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SOBPA7XYQ1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SOBPA7XYQ1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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