Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms