Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ATG4BQ9Y4P1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ATG4BQ9Y4P1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ATG4BQ9Y4P1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4BQ9Y4P1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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