Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms