Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms