Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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