Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms