Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms