Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRDM12Q9H4Q4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRDM12Q9H4Q4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms