Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms