Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms