Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD7-201ENST00000265224 1298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS1P2-201ENST00000439908 784 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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