Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms