Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms