Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms