Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms