Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms