Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms