Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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