Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms