Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms