Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms