Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms