Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
C16orf54Q6UWD8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms