Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms