Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCID2Q5JVF3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms