Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms