Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL40Q2TBA0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms