Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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