Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PDK4Q16654 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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